根据搜索结果，石首市果树苗基地主要分布在以下区域：

蔡宏果苗家庭农场

地址为石首市桃花山镇李花山村二组，成立于2015年，专注于果苗培育，注册资本0.003万元。

园博苗木种植专业合作社

位于石首市小河口镇中华路1号，成立于2019年，主营蔬菜、食用菌及园艺作物的种植，注册资本200万元。

补充说明：

永光果树种植家庭农场位于江汉平原，但搜索结果未明确标注其是否以果树苗种植为主；

桃花山镇是多个果树苗基地的集中区域，建议实地考察后选择。